滬港通交易需參考雙方交易規則，在交易時間方面，要根據雙方市場情況而定，因港股交所和上交所所規定的交易時間有所差異，同時加之香港臺風頻發，也會對交易有所影響，以及節假日對雙方結算和交收的影響，因此內地投資者在參與港股通交易時，要了解清楚港股通的具體交易時間，以免對交易造成影響。
每一交易日的交易時間
（01）開市前時段：輸入買賣盤時段：9:00—9:20（其中9:00—9:15港股通投資者可以通過競價限價盤申報和撤單，9:15—9:20則不可以）對盤時段：9:20—9:28暫停階段：9:28—9:30對盤階段和暫停階段均不可掛單和撤單
（02）持續交易時段：上午9：30—12:00（早市）下午13:00—16:00（午市）持續交易時段港股通的投資者可以通過限價盤進行申報和撤單，但不得修改訂單，同時在12:30—13:00可對已報但未成交的訂單進行撤銷。
（03）在聖誕前夕（12.24）、新年前夕（12.31）和農曆新年前夕，香港市場沒有午市交易。聯交所因緊急情況臨時延長交易時間的，港股通交易不作延長。
節假日對交易時間的影響
（01）交易時間的確定原則：交易日曆的確定原則是隻有當兩地市場都進行交易和結算，才能成爲港股通的交易日。
（02）在港股通開始交易之前或下一個交易年度之前兩地交易所會進行協商，最終制定交易日曆，由上交所SPV在其指定網站公佈。
惡劣天氣對港股通交易的影響
（01）港股通試點期間，對八號以上臺風和黑雨警告等惡劣天氣做了相關的交易安排，如遇颱風和黑雨等天氣，則按以下規則執行。
特別提示
注意以上因素對交易情況和資金劃轉的影響
