事業編制差額和全額的主要區別是單位資金供給的方式或解決方案不同。差額撥款事業單位，按差額比例，財政承擔部分，由財政列入預算；單位承擔部分，由單位在稅前列支，如醫院等。全額撥款事業單位也稱爲全供事業單位，也就是全額預算管理的事業單位，是其所需的事業經費全部由國家預算撥款的一種管理形式。
